Según la oficina del censo, en el año 2006, la ciudad de San Diego cuenta con una población de 1.261.251 personas, de los cuales:

47,7% son blancos (descendientes de europeos).
27,1% son latinos o hispanos (entre los que predominan los mexicanos).
15,3% son asiáticos.
6,9% son negros.
El resto lo conforman personas de otras razas.
La población de origen latino/hispano es la de más rápido crecimiento, debido a la alta tasa de fecundidad de las mujeres latinas residentes en los Estados Unidos, y también debido a la inmigración legal e ilegal proveniente de América Latina y el Caribe.

Según el censo del 2000, hay 1.223.400 personas (450.691 unidades de convivencia y 271.315 familias) viviendo en la ciudad. La densidad de población es 1456,4 hab/km². Hay 46.689 unidades de alojamiento con una densidad promedio de 559,1 por km².

Hay 450.691 unidades de convivencia de las cuales el 30,2% tiene hijos de menos de 18 años que viven con ellos, el 44,6% son parejas casadas que viven juntas, el 11,4% tiene un cabeza de familia femenino sin marido, y el 39,8% no son familias. El 28,0% de todas las unidades de convivencia consta de individuos solos (de los que 7,4% tienen más de 65 años de edad). El tamaño promedio de la unidad de convivencia es 2,61 personas y el tamaño de la familia promedia es 3,30.

El 24,0% de la población de la ciudad tiene menos de 18 años, el 12,4% entre 18 y 24, el 34,0% de 25 a 44, el 19,1% de 45 a 64 y el 10,5% 65 años o más. La edad media es de 32 años. Por cada 100 mujeres hay 101,7 hombres. Por cada 100 mujeres con más de 18 años hay 100,4 hombres.

El ingreso medio para una unidad de convivencia en San Diego es US$43.733 y el ingreso medio por familia es US$67.060. Los hombres tienen un ingreso medio de US$36.984 por US$31.076 de las mujeres. El ingreso per cápita para la ciudad es US$67.609. El 14,6% de la población y el 10,6% de las familias está por debajo de la línea de la pobreza. De la población total, el 20% de los menores de 18 años y el 7,6% de los mayores de 65 están debajo de la línea de la pobreza.

En 2004, el centro de la ciudad de San Diego tenia una población de 28,586. En 2010, la población estimada es de 45,710; en 2020, la población estimada es de 64,626; y en 2030, la población estimada es de 82,598, en la cual es un 189% de incremento desde el 2004.

El promedio de los ingresos de los hogares se estima que podría incrementar un 29% de $27,788 en 2004 a $35,871 en 2030. El grupo que crecer más desde 2004 y 2030 son los hogares que hacen más de $200,000, en la que se estima que se podría incrementar un 616% desde 428 a 3,064; hogares convirtiéndolos en $150,000-$199,999, y se estima que se incremente un 582% de 272 a 1,856; hogares que ganen $125,000-$149,999, en un incremento de 465% desde 266 a 1,502; y los hogares que ganen $100,000-$124,999, tendrán un incremento estimado del 370% desde 451 a 2,121.